内阁府 Cabinet Office
				综合科学技术会议 Council for Science and Technology Policy (CSTP)
				原子能委员会 Atomic Energy Commission
				原子能安全委员会 Nuclear Safety Commission
				食品安全委员会 Food Safety Commission
				经济社会综合研究所 Economic and Social Research Institute (ESRI)
				日本学术会议 Science Council of Japan (SCJ)
		国家公安委员会 National Public Safety Commission
		警察厅 National Police Agency		科学警察研究所 National Research Institute of Police Science
	总务省 Ministry of Internal Affairs and Communications (MIC)
				信息通讯审议会 Information and Communications Council	信息通讯技术分科会 Information and Communications Technology sub-Council
				信息通讯研究机构 National Institute of Information and Communications Technology (NICT)	宇宙航空研究开发机构 Japan Aerospace Exploration Agency (JAXA)
		消防厅 Fire and Disaster Management Agency (FDMA)		消防大学校 消防研究中心 National Research Institute of Fire and Disaster
	法务省 Ministry of Justice
				法务综合研究所 Research and Training Institute of the Ministry of Justice
	外务省 Ministry of Foreign Affairs
	财务省 Ministry of Finance
				关税中央分析所 Central Customs Laboratory
		国税厅 National Tax Agency		酒类综合研究所 National Research Institute of Brewing
	文部科学省 Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (MEXT)
				科学技术·学术审议会 Council for Science and Technology
				宇宙开发委员会 Space Activities Commission
				辐射线审议会 Radiation Council
				日本学士院 Japan Academy
				地震调查研究推进本部 Headquarters for Earthquake Research Promotion
				日本联合国教科文组织国内委员会 Japanese National Commission for UNESCO
				国立教育政策研究所 National Institute for Educational Policy Research (NIER)	科学技术政策研究所 National Institute of Science and Technology Policy (NISTEP)
		国立大学法人 National Universities		布置研究所 Laboratories Attached to Universities
				大学共同利用机关 Inter University Research Institutes
				国立科学博物馆 National Science Museum	辐射线医学综合研究所 National Institute of Radiological Sciences (NIRS)
				国立特殊教育综合研究所 National Institute of Special Education	防灾科学技术研究所 National Research Institute for Earth Science and Disaster Prevention (NIED)
				科学技术振兴机构 Japan Science and Technology Agency (JST)	海洋研究开发机构 Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology (JAMSTEC)
				日本学术振兴会 Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)	宇宙航空研究开发机构 Japan Aerospace Exploration Agency (JAXA)
				理化学研究所 RIKEN (Institute of Physical and Chemical Research)	国立奥林匹克运动会纪念青少年综合中心 National Institution for Youth Education
				物质·材料研究机构 National Institute for Materials Science (NIMS)	日本体育振兴中心 National Agency for the Advancement of Sports and Health
				日本原子能研究开发机构 Japan Atomic Energy Agency (JAEA)
		文化厅 Agency for Cultural Affairs		日本艺术文化振兴会 Japan Arts Council	文化财研究所 Nara National Research Institute for Cultural Properties
				国立国语研究所 National Institute for Japanese Language
	厚生劳动省 Ministry of Health, Labour and Welfare
				厚生科学审议会 Health Sciences Council
				国立社会保障・ 人口问题研究所 National Institute of Population and Social Security Research	国立感染症研究所 National Institute of Infectious Diseases
				国立医药品食品 卫生研究所 National Institute of Health Sciences	国立保健医疗科学院 National Institute of Public Health
				国立癌中心研究所 National Cancer Center Research Institute	国立循環器病センター 研究所 National Cardiovascular Center Research Institute
				国立循环器病中心 研究所 International Medical Center of Japan Research Institute	国立生长医疗中心 研究所 National Research Institute for Child Health and Development
				国立精神·神经医疗研究中心 / 精神保健研究所、 神经研究所 National Institute of Mental Health / National Center of Neurology and Psychiatry, National Institute of Neuroscience
				国立健康・荣养研究所 National Institute of Health and Nutrition	劳动政策研究·进修机构 Japan Institute for Labour Policy and Training
				医药品医疗机器综合机构 Pharmaceuticals and Medical Devices Agency	医药基础研究所 National Institute of Biomedical Innovation
				劳动安全卫生综合研究所 Japan National Institute of Occupational Safety and Health
	农林水产省 Ministry of Agriculture, Forestry and Fisheries (MAFF)
		农林水产技术会议 Agriculture, Forestry and Fisheries Research Council (AFFRC)
				农林水产政策研究所 Policy Research Institute, Ministry of Agriculture, Forestry and Fisheries (PRIMAFF)
				农业·食品产业技术综合研究机构 National Agriculture and Food Research Organization (NARO)	农业工学研究所 Natiolal Institute for Rural Engineering (NIRE)
				农业生物资源研究所 National Institute of Agrobiological Sciences (NIAS)	食品综合研究所 National Food Research Institute (NFRI)
				农业环境技术研究所 National Institute for Agro-Environmental Sciences (NIAES)	国际农林水产业 研究中心 Japan International Research Center for Agricultural Sciences (JIRCAS)
		林野厅 Forestry Agency		森林综合研究所 Forestry and Forest Products Research Institute (FFPRI)
		水产厅 Fisheries Agency		水产综合研究中心 Fisheries Research Agency (FRA)
	经济产业省 Ministry of Economy, Trade and Industry (METI)
				产业结构审议会 Industrial Structure Council
				产业技术综合研究所 National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST)	原子能安全基础机构 Japan Nuclear Energy Safety Organization (JNES)
				产品评价技术基础机构 National Institute of Technology and Evaluation (NITE)	信息处理推进机构 Information-technology Promotion Agency (IPA)
				石油天然煤气 ·金属矿物资源机构 Japan Oil, Gas and Metals National Corporation (JOGMEC)	工业知识产权信息·进修馆 National Center for Industrial Property Information and Training (NCIPI)
				新能源·产业技术综合开发机构 New Energy and Industrial Technology Development Organization (NEDO)	中小企业基础整备机构 Organization for Small and Medium Enterprises and Regional Innovation, Japan (SMRJ)
		资源能源厅 Agency for Natural Resources and Energy
		原子能安全·保安院 Nuclear and Industrial Safety Agency (NISA)
		专利厅 Japan Patent Office (JPO)
		中小企业厅 Small and Medium Enterprise Agency
	国土交通省 Ministry of Land, Infrastructure and Transport (MLIT)
				交通政策审议会 Council for Transport Policy
				国土技术政策综合研究所 National Institute for Land and Infrastructure Management
				国土地理院 Geographical Survey Institute
				土木研究所 Public Works Research Institute	港湾机场技术研究所 Port and Airport Research Institute
				建筑研究所 Building Research Institute	铁路建设·运输设施整备支援机构 Japan Railway Construction, Transport and Technology Agency
				交通安全环境研究所 National Traffic Safety and Environment Laboratory	宇宙航空研究开发机构 Japan Aerospace Exploration Agency (JAXA)
				海上技术安全研究所 National Maritime Research Institute	电子导航法研究所 Electronic Navigation Research Institute
		海上保安厅 Japan Coast Guard		海洋信息部 Hydrographic and Oceanographic Department
				海上保安考试研究中心 Coast Guard Research Center
		气象厅 Meteorological Agency		气象研究所 Meteorological Research Institute
	环境省 Ministry of the Environment
				中央环境审议会 Central Environment Council
				环境调查进修所 National Environmental Research and Training Institute	国立水俣病 综合研究中心 National Institute for Minamata Disease
				国立环境研究所 National Institute for Environmental Studies (NIES)
	防卫省 Ministry of Defense
	*The Japan Defense Agency was upgraded to the Ministry of Defense on January 9, 2007

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